Fortunat Frölich studierte Violoncello und Gesang, sowie Orchesterleitung am Konservatorium Zürich, am Conservatorio di Napoli und an der Musikhochschule Leipzig. Er wirkte als Cellist und Sänger in unzähligen Formationen verschiedenster Prägung mit: Von 1989-2002 war er Solocellist des Bündner Kammerorchesters. Er gründete 1982 das Ensemble um die Tessiner Volkslied-Sängerin La Lupa und 2000 ein Duo mit dem marokkanischen Darboukka-Virtuosen Samir Essahbi. Als Solo-Bariton wirkte Fortunat Frölich in Uraufführungen von Hans Jürgen von Bose (Opernhaus Zürich), John Gray, Walther Giger (Orcadian Conflux Festival, Ile of Orkney), Daniel Mouthon und Hermann Bühler mit, und begleitete das Solistenensemble Basler Madrigalisten auf vielen internationalen Tournéen.

Als Dirigent und Komponist arbeitete Fortunat Frölich mit Juliane Banse, Susanne Elmark, Christian Zehnder, Reem Talhami, dem Sinfonieorchester Basel, Hamburger Symphoniker, Bohuslav Martinu Philharmonie Zlin, Opernhaus Biel/Solothurn, Karlovivary Symphony Orchestra, Sinfonietta Lausanne, basel sinfonietta, Orchestra Filarmonica di Torino, Zürcher Kammerorchester, Ensemble Resonanz Hamburg, KammerphilharmonieGraubünden, The North of England Chamber Orchestra, Ensemble Phoenix, Casal Quartett, Basler Madrigalisten, Chorale du Conservatoire National du Maroc und vielen anderen mehr zusammen.

Ein Spezialgebiet in der Arbeit von Fortunat Frölich betrifft die Interkulturalität. Bereits 1991 realisierte er ein erstes Begegnungsprojekt „Leh ya Jarè" als kulturelle Antwort auf fremdenfeindliche Ausschreitungen in der Schweiz und in Deutschland. Dieses Projekt wurde vom Schweizer Musikrat und dem Kultusministerium Baden-Württemberg ausgezeichnet und erlebte seither in vielen Schweizer Städten, sowie in Deutschland undMarokko zahlreiche Aufführungen. 1999 und 2002 leitete Frölich das Projekt „moi-toi-musique" mit Tuareg - Musikern in Niger und am Internationalen Festival de Rabat in Marokko. Von 2001 bis 2005 war er regelmässiger Gastdozent für Chorleitung am Conservatoire National du Maroc. 2006 wurde seine interkulturelle Komposition „aanilhoub/about love" am Festival MAWAZINE / rythmes du Monde in Marokko uraufgeführt und von Radiotelevision Marocaine RTM aufgezeichnet. 2012 wurde er von MAROC CULTURES zur Koproduktion eines auf dem marokkanischen Liedgut basierenden Werkes eingeladen, welches nach seiner Uraufführung am internationalen Festival MAWAZINE auch am STIMMENFESTIVAL Lörrach, THEATERSPEKTAKEL  Zürich und am FIT Festival Internationale del Teatro in LUGANO gezeigt wurde. Frölich gründete den Verein choRinteR kultuR welcher regelmässig interkulturelle Projekte durchführt.